Zamiast aplikacji w sklepie znajduje się jedynie informacja, by skorzystać z przeglądarkowej wersji serwisu. Ani Microsoft ani Facebook nie wydali jak dotąd oficjalnego oświadczenia oznajmującego przyczynę tego stanu rzeczy. Wiele osób uważa, że jest on spowodowany niskim zainteresowaniem aplikacją. Na szczęście Microsoft Store wciąż oferuje Messengera.